有机化合物结构的确定，可利用有机化合物的化学性质，确定分子中的官能团，再确定其所在的位置。也可利用核磁共振谱和红外光谱等现代化的方法确定。
1.有机化合物中官能团的确定
官能团决定了有机化合物的特殊性质，我们可以通过一些特殊的化学反应和实验现象，确定有机化合物的官能团。
（1）碳碳双键和碳碳三键
含碳碳双键或者是碳碳三键的有机化合物可使溴的四氯化碳溶液（红棕色）褪色，也可使酸性高锰酸钾溶液（紫色）褪色。
（2）卤素原子
卤代烃在氢氧化钠溶液、硝酸银溶液和稀硝酸的混合溶液中反应，可生成白色沉淀（AgCl）、黄色沉淀（AgBr）、橙色沉淀（AgI）。
（3）醇羟基
醇羟基和金属钠反应，放出氢气。
（4）酚羟基
酚羟基可以和浓溴水反应生成白色沉淀，也可以使黄色的氯化铁溶液显紫色。
（5）醛基
含醛基的有机化合物可以和银氨溶液反应，生成银镜，也可以和新制的氢氧化铜溶液反应生成砖红色沉淀。
（6）羧基
含羧基的有机化合物可以和碳酸氢钠溶液反应，放出二氧化碳气体。
2.核磁共振谱（NMR）
核磁共振谱分为氢谱和碳谱，比较常用的是氢谱。氢谱能够确定有机化合物中氢原子在碳骨架上的位置和数目，进而推断出有机化合物的碳骨架结构。
如：乙醇分子的核磁共振谱图中有三个不同的峰，且峰面积比为1：2：3，这说明乙醇分子中存在三中不同化学环境的氢原子，且它们的个数比为1：2：3。